安装好消毒柜后，要掌握正确的使用方法。通常，消毒柜的使用电源为50Hz、220V的单相交流电。使用时，必须使用单相三脚插座，规格选250V、10A为好，并且插座接地脚必须安装牢固可靠的接地线。
使用时，先将餐具洗净，稍晾干，按类别倒放或斜放在消毒柜室的层架上。有盖的餐具应打开盖子，筷子及勺子和锅铲等插到门内的筷子架内。耐温低于150摄氏度的餐具不宜放进高温型电子消毒柜内消毒，以免变形、烤焦或溶化。耐低温的餐具宜放入低温型电子消毒柜内消毒，并留有适当的间隙，以便让臭氧与其表面充分接触，增强杀菌效果。
使用高温消毒柜消毒时，先将洗净的餐具放好，再将电源线的插头插入市电插座内，按下按钮，电源指示灯亮，表示开始加温消毒。待指示灯自动熄灭，表示消毒完毕。刚消毒结束时，柜内的餐具处于120摄氏度以上，切勿随即使用餐具，以免烫伤皮肤，一般经10-20分钟左右的时间方可取出使用。若暂时不使用餐具，最好不要打开柜门，这样消毒效果可维持数天。
使用消毒柜时，先根据放入餐具的多少，将定时器的旋钮置于适当时间的档位上，插入电源插头，待指示灯亮，开始臭氧消毒，待指示灯熄灭，表示臭氧消毒完毕。若烘干指示灯亮，表示正烘干餐具。待烘干指示灯自动熄灭时，消毒、烘干程序完成。
